服务简介:
STR ( Short Tandem Repeat, 短串联重复序列)基因分型技术是细胞身份鉴定最准确有效的方法,被ATCC、ICLAC等权威机构认定为细胞鉴定的金标准。STR基因位点由长度为3~ 7个碱基对的短串连重复序列组成,广泛存在于人类基因组中,被称为细胞的DNA指纹。通过对这些STR位点的检测,将检查结果与专业的STR数据库比对,从而确定被测细胞的真实身份,或判断被测细胞是否与某些细胞,发生交叉污染。
人源细胞STR分型(cell line STR genotyping),是选用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19个具有高度多态性基因座和一个性别基因位点Amelogenin对人源细胞进行STR分型检测。根据STR分型结果对细胞的生长状态(是否存在交叉污染)和细胞的株系进行确认的技术手段。
内容步骤:
1.确定STR位点,设计实验方案,包括荧光标记的选择,引物的设计、合成和标记,荧光分子量内标的选用等。
2.按照所设计的实验方案完成荧光PCR,利用琼脂糖电泳检测结果;若PCR产物特异性不够,将进行优化。
3.PCR产物通过ABI 3730XL测序仪器进行毛细管电泳检测,获得扩增片段大小的数据
4.用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等软件对收集到的数据进行处理分析,将产物片段大小、数量多少的信息转化成直观准确的波形图谱,为下一步进行关联分析或连锁分析等遗传分析提供可靠的数据。
服务内容:
细胞收集,基因组DNA提取
荧光引物PCR扩增21个str位点
产物经测序仪电泳,获得细胞基因分型结果
结果与ATCC、DSMZ、JCRB和RIKEN等细胞库比对和分
样品要求:
1. PCR产物或基因组DNA:浓度≥200ng/ul,总体积≥20ul,OD260/280在1.7至2.0之间;新鲜组织样品:总量≥100mg的新鲜组织样品或1~2ml血液样品
2. PCR产物或基因组DNA请提供样品的电泳检测图
3. 由于在实验过程中,可能会出现某些STR位点难以检测的情况,建议提供3~4个备选STR位点
4. 建议使用6FAM, VIC, NED以及PET四种荧光标记
5. 为尽量避免多种荧光信号的相互干扰,不建议同管检测使用的荧光多于2种,多种荧光同管检测,PCR产物大小需相差50bp以上
6. STR检测中常会出现一些比正常产物短2~4个碱基的峰,这是由截断PCR造成的,属于正常现象,并不会影响实验结果的分析。
服务流程:
方案沟通 合同确认 收到样品 实验结果交付并反馈 实验结束
如何下单:
1 . 邮件咨询下单:填写实验项目的信息后,发送至邮箱2062834891@qq.com。
2 .在线咨询下单:点击屏幕右侧“在线咨询”,或扫描二维码添加微信,或拨打咨询电话15810756989,我们会尽快安排工作人员与您联系!